Human GeCKO v2 全基因组 KO 初筛
围绕人类全基因组范围开展 unbiased discovery，适用于依赖基因、耐药机制和功能基因挖掘项目。
Genome-Scale Pooled CRISPR Knockout Screening
Human GeCKO v2 全基因组 CRISPR/Cas9 敲除筛选服务
基于 Feng Zhang 团队 Human GeCKO v2 pooled CRISPR knockout screening 文库， 面向人类全基因组范围开展高通量 loss-of-function 功能筛选， 适用于药物响应、依赖基因、耐药机制、功能基因和候选靶点挖掘。 服务不仅覆盖筛选实验实施，同时提供 NGS 数据分析、候选基因排序和通路解析。
19,050覆盖 19,050 个人类基因，适用于 genome-scale 功能筛选。
123,411总计 123,411 条 gRNA，满足 pooled CRISPR screening 覆盖需求。
一站式从筛选设计到 NGS 数据分析、基因排序与通路解析完整交付。
Technical Overview
技术简介
将 Human GeCKO v2 pooled sgRNA 文库导入细胞群体，在药物处理、增殖竞争、存活压力或表型分选等条件下比较筛选前后 sgRNA 丰度变化，从而在全基因组范围识别与目标表型相关的关键基因与通路。
Human GeCKO v2 pooled CRISPR knockout screening
Human GeCKO v2 由 Feng Zhang 团队开发，面向人类全基因组功能筛选。服务围绕 pooled knockout screen 设计、感染与筛选实施、NGS 数据分析、候选基因排序和通路解析展开，适用于需要系统识别功能基因与调控通路的项目。
对依赖基因、药物响应、耐药机制与候选靶点挖掘等项目，该路径能够提供更高通量、更系统的功能发现能力。
筛选主线
1
Human GeCKO v2 文库感染细胞群体，建立 pooled knockout 初始池。2
施加药物、存活、增殖或分选压力，形成目标表型差异。3
扩增 sgRNA 区域并进行 NGS，比较筛选前后丰度变化。4
在基因层面识别富集 / 耗竭信号，输出 hits 排序与通路解析结果。Library Features
Human GeCKO v2 文库特点
文库设计围绕人类全基因组功能筛选展开，兼顾基因覆盖广度、gRNA 数量和实验策略灵活性，适合从半库到全库的不同筛选需求。
19,050人类基因
面向 19,050 个人类基因开展 genome-scale loss-of-function 功能筛选。
123,411条 gRNA
总计 123,411 条 gRNA，为 pooled CRISPR screen 提供高规模覆盖能力。
A / B双半库设计
支持 A、B 两个半库独立使用，也可组合为 A+B 全库方案。
1,000对照 / 半库
每个半库均含 1,000 条 non-targeting controls，便于筛选质控与统计归一化。
Service Scope
服务内容
服务不止于 pooled CRISPR knockout 筛选本身，还覆盖 NGS 解卷积、候选基因优先级排序与通路层面的结果解析。
A / B 半库与 A+B 全库方案设计
根据细胞量、筛选窗口、项目预算和实验复杂度，选择半库或全库策略，降低盲目上库带来的成本与风险。
感染、筛选与样本构建
覆盖文库感染、筛选条件实施、样本时间点设计及后续 sgRNA 扩增样本构建，形成稳定的 pooled screening 流程。
NGS 数据分析与候选基因排序
从 FASTQ 到 sgRNA count、gene ranking、pathway enrichment，输出可直接用于决策的结果层信息。
Applications
应用场景
适用于围绕药物反应、细胞生存、功能依赖和表型变化开展的高通量功能筛选项目，帮助更快锁定具有后续验证价值的候选基因与通路。
药物耐药机制筛选
识别导致耐药表型出现或维持的关键基因与通路，为耐药机制解析提供线索。
药物敏感性增强因子
寻找能增强药物响应或协同药效的调控因子，支持联合治疗与靶点组合探索。
依赖基因发现
围绕细胞存活、增殖与竞争优势识别依赖基因，服务于肿瘤与疾病模型研究。
合成致死靶点探索
在特定遗传背景或药物条件下挖掘合成致死相关候选靶点，支持精细化筛选设计。
免疫相关功能基因筛选
适用于免疫治疗、免疫逃逸与细胞表面表型调控相关项目的功能基因发现。
特定表型调控因子挖掘
围绕凋亡、分化、迁移、分选富集等目标表型，定位驱动表型变化的关键因子。
Workflow
标准流程
按项目推进顺序搭建 6 步时间线，从筛选需求到结果报告形成清晰闭环，便于客户快速判断项目所处阶段与所需输入。
1
需求沟通
明确细胞模型、目标表型、筛选压力、重复策略和项目输出目标。
2
文库策略选择
根据项目规模与条件确定 A 半库、B 半库或 A+B 全库方案。
3
细胞模型与感染优化
围绕感染效率、覆盖度与筛选窗口优化实验输入条件。
4
筛选实施
执行药物处理、增殖竞争、存活压力或分选等 pooled screening 条件。
5
sgRNA 测序
扩增 sgRNA 区域并开展 NGS，获得后续计数与差异分析所需数据。
6
生信分析与报告
完成计数、候选基因排序、通路富集与结果解释，形成项目交付材料。
Bioinformatics
数据分析
数据分析不止停留在 reads 质控和 sgRNA 计数，而是进一步完成 gene-level ranking、pathway enrichment 与候选结果优先级整理，帮助更快进入后续验证阶段。
1. Reads 质控
对测序原始数据进行质量评估，确认读长、质量分布和样本完整性。
2. sgRNA 比对与计数
将 reads 映射至 Human GeCKO v2 文库序列，生成 sgRNA count matrix。
3. 归一化与重复一致性评估
比较组间分布与重复相关性，判断筛选窗口与数据稳定性。
4. Gene-level ranking
结合经典 CRISPR screen 分析思路，对富集 / 耗竭基因进行统计排序。
5. 通路解析与 hits 优先级整理
输出 pathway enrichment 和候选基因优先列表，提升结果解释与后续验证效率。
可交付图表
Sequencing QC Summary
测序质量统计、reads 分布与样本层质控摘要。
sgRNA Count Distribution
各样本 sgRNA 计数分布、覆盖度与库复杂度概览。
Sample Correlation Heatmap
重复一致性与组间差异的相关性热图。
Gene Ranking Plot
候选基因富集 / 耗竭排序结果与显著性分布。
Pathway Enrichment Chart
显著通路富集条形图、气泡图或网络关系图。
Hit Prioritization Table
候选基因优先级排序表，便于后续验证与项目决策。
Deliverables
交付内容
交付围绕实验过程可追踪、数据结果可复用、候选基因可决策展开，便于客户直接衔接内部复筛、验证或后续机制研究。
项目方案说明
包含文库策略、筛选逻辑、样本设计和分析框架摘要。
实验流程与 QC 摘要
提供项目执行过程中的关键节点和基础质量控制信息。
FASTQ 原始数据
交付测序原始文件，便于内部存档与后续复核。
sgRNA Count Matrix
提供各样本 sgRNA 计数矩阵，用于下游统计分析和数据复用。
Gene Ranking 与比较结果
输出候选基因排序、富集 / 耗竭趋势及组间比较结果。
通路解析与完整报告
包含 pathway enrichment 图表、候选基因列表及后续验证建议。
FAQ
常见问题
针对 Human GeCKO、pooled CRISPR screening、sgRNA screen 设计与交付中最常见的问题集中说明。
如果项目受限于细胞数量、覆盖度或预算，可优先选择 A 或 B 单半库；如果希望获得更完整的全基因组覆盖与更高筛选冗余度，可选择 A+B 全库策略。
单半库更适合快速初筛和资源受限项目；A+B 全库则在 gRNA 冗余度和筛选覆盖上更充分，适合对结果稳健性要求更高的项目。
多数 pooled CRISPR/Cas9 knockout screening 项目需要具备稳定 Cas9 表达的细胞基础，以确保 sgRNA 导入后能够实现持续有效的基因敲除。
适用于药物敏感性 / 耐药、增殖竞争、存活压力、细胞分选富集、特定功能状态变化等可转化为组间差异比较的表型场景。
提供。服务不仅包含 NGS 数据处理和 sgRNA 计数，还包括候选基因排序、通路解析、图表整理与结果报告输出。
可以。交付结果会提供候选基因优先级排序与解析线索，便于后续设计复筛、单基因验证或靶点功能研究。
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让全基因组 CRISPR 筛选更快进入可决策阶段
围绕 Human GeCKO v2 pooled CRISPR knockout screening，获取适合当前细胞模型、筛选窗口与项目目标的实施方案。
